Catherine Chandler, jeune avocate des beaux quartiers, quitte seule une soirée après s'être disputée avec son fiancé. Agressée et laissée pour morte dans Central Park, le visage tailladé, elle est secourue par Vincent, un homme-lion qui l'emmène dans le monde souterrain ou son apparence le condamne à vivre caché. Là vit une petite communauté d'exclus dirigée par Père. Soignée par Vincent, Catherine reprend des forces et retourne dans le monde d'En-haut, après lui avoir promis de garder le secret. Une fois remise de ses blessures elle rompt avec son fiancé et quitte le cabinet d'avocats de son père pour se faire embaucher au bureau du Procureur. Vincent, lié à elle par une connexion psychique, n'est pas parvenu à l'oublier. Il lui rend visite un soir sur son balcon et ils parlent jusqu'au matin. Enquêtant sur sa propre agression, Catherine se retrouve en danger de mort. Averti par le lien qui les unit, Vincent vient à son secours et massacre sauvagement les agresseurs. Ils se séparent dans les tunnels, sachant que leurs vies sont liées et qu'ils sont destinés à se revoir.

Un "vengeur" masqué et vêtu d'une cape massacre les voyous qui agressent les passagers du métro. Catherine craint un moment que ce ne soit Vincent. Son enquête l'amène vers un groupe privé de défenseurs de l'ordre, dont le chef est le fameux vengeur. Quand Catherine se retrouve en danger face à eux, Vincent accourt à la rescousse, et à la suite d'une course-poursuite dans les tunnels, le vengeur tombe dans l'Abysse.

Lors d'une soirée, Catherine fait la connaissance du séduisant promoteur Elliot Burch, pendant que Vincent sauve des personnes âgées d'un incendie allumé pour les déloger de leur immeuble. Il prévient Catherine, qui découvre que c'est pour faire place à un des projets immobiliers d'Elliot que des hommes de main ont été chargés de faire fuir les locataires. Elliot n'était pas au courant des méthodes employées, mais sa réaction désinvolte quand elle lui en parle met fin à l'idylle qui s'était ébauchée entre eux et désespérait Vincent. Les voyous s'attaquent de nouveau aux locataires alors que Catherine se trouve avec eux et Vincent vient les sauver. L'épisode se termine avec Catherine trouvant les Sonnets de Shakespeare sur son balcon, tandis qu'on entend la voix de Vincent réciter le Sonnet XXIX.

En tentant d'aider Catherine qui enquête sur une guerre entre bandes, Vincent est blessé et rendu aveugle par une explosion. Capturé et torturé par les membres de la bande, il en tue un pour s'échapper et les autres le poursuivent tandis que Catherine le cherche partout. Grâce à l'aide d'une prostituée et d'un membre un peu 'simple' du gang, il parvient à regagner les tunnels, où il retrouve Catherine et Père.

A Halloween, Catherine et son père assistent à un bal masqué en l'honneur d'une écrivaine irlandaise, Bridget O'Donnell. Vincent, qui a lu ses livres, a lui aussi envie de la rencontrer et vient au bal. Voyant Vincent passer en compagnie d'une autre femme, Catherine les suit, sans se rendre compte qu'elle est elle-même suivie, et se retrouve en plein dans un règlement de comptes de l'IRA, ou personne n'est ce qu'il paraît être. Vincent intervient pour la sauver ainsi que Bridget. Une fois le danger écarté, Catherine et Vincent parcourent ensemble les rues de la ville jusqu'à l'aube. Puis, la nuit magique de Halloween étant finie, Vincent doit regagner les tunnels.

Une enquête sur la corruption sur les docks amène Catherine à inspecter de près les affaires de Mitch Denton, ancien habitant des tunnels. Kidnappée par Mitch et ses hommes, elle est blessée d'une balle dans le dos en s'échappant. Vincent l'emmène à l'hôpital puis part à la poursuite de ses agresseurs. Il massacre les hommes de Mitch, qui ne doit la vie sauve qu'à la reprise de conscience de Catherine. Vincent va la voir la nuit à l'hôpital, et elle lui raconte un rêve ou ils marchaient tous les deux en plein soleil sur la 5^ème Avenue, sans que personne ne les regarde.

Catherine accepte un emploi à Providence, dans le Rhode Island. Bien qu'il l'y ait encouragée, Vincent est désespéré par l'idée de son départ. Sa vigilance se relâche et il est capturé, drogué et mis en cage dans un laboratoire par un anthropologue aidé d'un de ses étudiants. Alertée par Père, Catherine finit par trouver un témoin et remonte jusqu'aux kidnappeurs. L'étudiant, qui veut garder la découverte pour lui seul, tue le professeur et menace Catherine, qui parvient à l'attirer assez près de la cage pour que Vincent puisse le tuer. Elle ramène Vincent dans les tunnels et lui annonce qu'elle n'ira pas à Providence.

Un de ceux qui aident la Communauté d'En-Bas fait parvenir à Père une énigmatique annonce trouvée dans un journal. A sa lecture celui-ci décide de retourner En-Haut, ce qu'il n'avait pas fait depuis des années. En arrivant chez l'avocat qui avait fait paraître l'annonce, il trouve celui-ci mort et se fait arrêter pour meurtre. Vincent inquiet demande l'aide de Catherine, et leur enquête les conduit à découvrir le vrai nom de Père, Jacob Wells, et son passé de médecin victime du Maccarthysme. Catherine retrouve Père en prison. Elle tente d'entrer en contact avec Margaret, l'ex-femme de Père, qui, mourante, avait mis l'annonce pour le retrouver, mais se heurte à un évangéliste cupide, qui vise l'héritage de Margaret et a assassiné l'avocat. Vincent aide Catherine à s'échapper, elle fait libérer Père, et en le ramenant dans son monde, elle lui dit qu'elle aime Vincent. Margaret attend Père En-Bas et passe ses derniers jours avec lui.

Une enquête sur un meurtre amène Catherine dans le monde des rites Vaudou. Elle est menacée, son appartement saccagé, et elle a des hallucinations. Vincent va demander conseil à Narcissa, la 'sorcière' des tunnels. Quand le prêtre Vaudou tente de sacrifier Catherine à son dieu, Vincent vient la sauver, déclenchant un incendie dans la bagarre. Le prêtre le prend pour son dieu et marche droit dans les flammes.

10 Une histoire pour enfants (A Children's Story)

Alertée par Vincent, Catherine enquête sur un orphelinat à la réputation irréprochable et découvre un trafic d'enfants destinés à devenir pickpockets pour le compte d'un malfaiteur. Avec l'aide de Vincent Catherine met fin au trafic et ramène le petit Eric et sa sœur Ellie vivre dans les tunnels.

Laura, une jeune sourde-muette qui vit dans les tunnels, est témoin du meurtre d'un officier de police, dont un innocent est accusé. Elle se rend En-Haut avec Catherine pour témoigner, mais se fait kidnapper par les vrais meurtriers, policiers eux aussi. Enchaînée à un tuyau dans les sous-sols, elle parvient à taper un SOS qui est reçu par Pascal, et Vincent vient la sauver.

En voulant secourir le petit Eric, qui s'est blessé en jouant dans le Labyrinthe, Père et Vincent sont piégés par un effondrement. Catherine, qu'une enquête a amenée à revoir Elliot Burch, sent que Vincent est en danger et s'aventure seule dans les tunnels. Elle se perd et aboutit dans l'atelier de Mouse, un peu simple d'esprit mais inventeur parfois génial, qui l'emmène vers le Labyrinthe. Là toute la communauté s'est rassemblée pour aider Père et Vincent, sans succès. Une des inventions de Mouse pourrait les sortir du piège, mais il a besoin de matériel spécialisé. Catherine retourne voir Elliot, qui lui donne ce qu'elle veut sans poser de questions, et Mouse parvient à délivrer les prisonniers. Père se montre un peu plus compréhensif vis à vis de la relation entre Catherine et Vincent. En la raccompagnant, Vincent remercie Catherine de son courage, et elle répond qu'il ne s'agit pas de courage, mais d'amour.

Lin, une jeune chinoise, est fiancée à un homme qu'elle n'aime pas. Vincent et Catherine tentent d'intervenir auprès de son grand-père, un ami de Père, mais celui-ci invoque la tradition. Après que celui qu'elle aime, Henry, ait accidentellement tué le fiancé de Lin, ils se réfugient dans les tunnels. Le fiancé était le petit-fils d'un homme puissant, chef des Triades chinoises. Il connaît l'existence des tunnels et y descend avec ses hommes pour se venger. Pour protéger son monde, Vincent doit les tuer tous. Lin et Henry se marient En-Bas. Pendant la cérémonie, Catherine et Vincent se regardent…

Une nouvelle drogue très dangereuse circule dans New York. Le fournisseur se fait payer en or, et Catherine le soupçonne de se cacher dans les tunnels. Averti, Père va parler à John Pater, dit "Paracelse", un de ses anciens compagnons banni de la communauté des années auparavant. Celui-ci ne répond que par des menaces. En le poursuivant, Vincent est exposé à la drogue, qui le plonge dans de violentes hallucinations. Dans son délire il blesse Père, et seule Catherine parvient à l'approcher et à le calmer. Vincent affronte Paracelse dans son laboratoire. Un incendie se déclenche et Paracelse y disparaît, refusant d'abandonner son or.

Alors que Catherine et Vincent se préparent à fêter le premier anniversaire de leur rencontre, Joe fait la connaissance d'une ravissante avocate, Erica, qui travaille pour un homme contre qui il a engagé des poursuites. Elle lui propose de quitter le bureau du procureur pour rejoindre la firme ou elle travaille. Joe refuse, et se fait alors piéger et arrêter pour possession de drogue. Catherine va parler à Erica. Celle-ci, menacée à mots couverts par son patron, lui demande de l'aide. Poursuivies par un homme armé, elles sont sauvées par Vincent. Joe est lavé de tout soupçon et peut reprendre son enquête. Catherine et Vincent célèbrent leur anniversaire en s'offrant des cadeaux, un cristal sur une chaîne d'or pour Catherine, et une rose d'ivoire dans une poche de cuir pour Vincent.

Un nouvel avocat vient travailler au bureau du procureur. Un soir Catherine le suit pour lui remettre un dossier et le voit avec surprise traverser le parc vers l'entrée des tunnels, ou il semble chercher quelque chose. A sa description, Vincent reconnaît Devin, son frère adoptif, disparu 20 ans auparavant après s'être disputé avec Père. Une sortie nocturne sur le Carrousel du parc qu'il avait organisée pour Vincent avait failli mal tourner, et Père le lui avait violemment reproché. Nombreux flash-back de souvenirs d'enfance. Père est furieux que Devin se fasse passer pour un avocat. Catherine discute avec Devin, qui accepte de démissionner. Vincent apprend que Devin est en fait le fils biologique de Père, ce qu'il n'a jamais su. Aidé de Catherine, il arrange une rencontre au Carrousel entre le père et le fils, qui se réconcilient. Quand Devin quitte finalement New York, c'est sous le nom de Devin Wells.

Stephen Bass, un ancien petit ami de Catherine, réapparaît dans sa vie, se prétendant mourant. Vincent, après un rêve prémonitoire, conseille à Catherine de s'éloigner de Steven. Le croyant simplement jaloux elle refuse, et se retrouve prisonnière dans une maison loin de New York, menacée par Stephen dont la possessivité tourne à la folie. Elle s'enfuit dans les bois pendant que Vincent accourt à la rescousse. Il blesse très grièvement Stephen, qui allait étrangler Catherine. Plus tard, elle lui demande pardon de ne pas l'avoir écouté.

Mouse découvre les restes d'un navire qui contient un coffre au trésor. Pendant que les habitants d'En-Bas discutent de l'usage à faire de cette fortune, un collier que Mouse a offert à Catherine attire l'attention d'un expert sans scrupules. Cullen, un des habitants des tunnels, rendu fou par la fièvre de l'or, va jusqu'à blesser Mouse pour emporter une part du butin En-Haut. Repéré et suivi par l'homme, il se bat avec lui, Vincent intervient et l'intrus tombe dans l'Abysse. Finalement, sur la suggestion de Vincent, le trésor sera offert à une œuvre religieuse qui s'occupe des sans-abri.

19 Tout, c'est tout (Everything is Everything)

Vincent et Catherine aident un jeune gitan, Tony, à rétablir ses droits et la mémoire de son père devant le tribunal gitan, le "Kreesh", et à faire condamner son oncle, qui était le véritable coupable.

L'épisode commence sur Vincent racontant la mort de Winslow. Paracelse, vivant, mais défiguré, fait kidnapper Catherine et la garde prisonnière au plus profond des tunnels. Il envoie un message pour attirer Vincent à sa perte. Pascal et Winslow accompagnent Vincent. En chemin ils sont attaqués et Winslow est tué. Jamie, qui les avait suivis, sauve Pascal grâce à son arbalète. Winslow enterré, Vincent continue seul jusqu'à l'antre de Paracelse. Il doit affronter un géant aussi fort que lui, pendant que Catherine est menacée par les flammes. Il tue son assaillant et libère Catherine, Paracelse s'enfuit encore une fois. Sur le chemin du retour, Catherine répète à Vincent qu'elle l'aime, et ferait n'importe quoi pour lui.

Les Tunnels Peints d'Elizabeth, et le monde d'En-Bas tout entier, sont menacés par des dynamitages. Ce sont les travaux de fondation d'une tour gigantesque que projette de construire Elliot Burch. Mouse, qui s'est introduit sur le chantier, est capturé par les hommes d'Elliot, et Catherine doit intervenir auprès de celui-ci pour le faire libérer. Elliot, qui est toujours amoureux d'elle la demande en mariage, et Catherine, prête à tout pour sauver Vincent et son monde, accepte de l'épouser à condition qu'il renonce à son projet. Il refuse, mais elle parvient à trouver un moyen légal d'arrêter les travaux. L'épisode se termine sur une vue d'Elliot dans son bureau, contemplant la maquette de sa tour qui ne sera jamais construite, pendant que la voix de Vincent récite "Ozymandias" de Shelley.

Au vingtième anniversaire de la mort de sa mère, disparue quand elle avait 10 ans, et tourmentée par sa relation sans issue avec Vincent, Catherine sombre dans la dépression. Elle va jusqu'à consulter un psychiatre qui est incapable de l'aider car elle ne peut pas lui parler de Vincent. Après s'être enfuie en larmes d'un concert, parce qu'elle ne supportait plus que l'homme qu'elle aime ne puisse pas l'écouter avec elle, elle cherche refuge auprès de Vincent. Déchiré, il lui annonce que leur relation doit s'arrêter là parce qu'elle en souffre trop. Il lui dit qu'elle doit vivre sa vie dans le monde d'En-Haut, la vie 'normale', heureuse que sa mère souhaitait pour elle, et il ferme la porte sur elle malgré ses protestations. Catherine se réfugie chez une amie, Nancy Tucker, Celle-ci, mariée et mère de famille, est l'exemple de cette 'vie heureuse' que Vincent voudrait pour Catherine. Là, après un rêve révélateur et une discussion avec Nancy sur les choix que l'on doit faire dans l'existence, Catherine, en pleine nuit, décide de retourner auprès de Vincent. Ayant senti son retour, il l'attend à l'entrée des tunnels, et elle se jette dans ses bras en lui disant qu'elle regrette d'avoir douté, que ce qu'il y a entre eux est tout ce qui compte pour elle. Et là, logiquement, ils devraient s'embrasser, mais la frilosité des producteurs les condamne à n'échanger que 'l'ombre d'un baiser'.